Binnenlandse vluchten
De belangrijkste luchtvaartmaatschappij voor binnenlandse vluchten is nog altijd MIAT Mongolian Airlines (www.miat.mn) met zijn redelijk grote vloot van voornamelijk Russische machines, waarmee elk vliegveld in Mongolië kan worden bereikt (er zijn 44 vliegvelden, waarvan maar een kwart een verharde landingsbaan heeft). Een bescheiden concurrent is Aero Mongolia (www.aeromongolia.mn) dat met Fokkers vliegt, maar een beperkt net heeft.
Een nieuwe maatschappij voor het binnenlands vliegverkeer is EZnis Airways (lees: Easyness Airways). Men vliegt met Zweeds materieel (SAAB) naar 10 bestemmingen in alle uithoeken van het land (www.eznis.com).
Voor alle maatschappijen geldt dat hun beleid wat ondoorzichtig is. Regelmatig vallen vluchten uit, om wat voor reden dan ook. Omdat de meeste boekingen lopen via lokale agenten, is het de reiziger zelfs op de dag van vertrek vaak nog niet duidelijk of er wordt gevlogen en zo ja op welk tijdstip. Enige flexibiliteit en engelengeduld zijn wenselijk.
Spoorwegen
Dwars door Mongolië, van noord naar zuid, loopt één hoofdspoorlijn, die van de Trans Mongolian Railway. Treinen stoppen alleen in Ulaanbaatar, dus voor het binnenlands verkeer is deze van geen belang. U zult gebruik moeten maken van treinen die over hetzelfde spoor lopen, maar meer haltes hebben. Over de hoofdlijn gaan dagelijks treinen van Ulanbaatar noordwaarts naar Sükhbaatar via Darkhan en zuidwaarts naar Zamyn-Üüd via Choir en Sainshand. De lijn heeft twee zijtakken, naar respectievelijk de kopermijnen van Erdenet (vanaf Darkhan) en de kolenmijnen van Baganuur (vanaf Ulaanbaatar). Verder is er in Oost-Mongolië een niet dagelijks bereden lijn van Choibalsan naar Chuluunkhoroot aan de Russische grens (geen grensoverschrijdend personenvervoer).